Science:从表观层面解析为何“**有别”

2021-11-29 02:31:01 来源:
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已有的分析显示,许多比较简单的全人类表现型,包括结核病,都表现成性别歧视差异的特征。这些性别歧视差异被不尽彼此之间同程度地并不认为生理、性染色体、DNA型×性别歧视不稳定性、行径差异和环境暴露的差异。然而,至今为止,它们的前提和基本生物学原理在很小程度上仍然是未确定的。

DNA型-民间组织理解(GTEx)项目提供了一个机会,让我们可以通过分析许多之前未曾以这种手段表征的民间组织,来探寻全人类激活组中的性别歧视差异的普遍性和表型前提。

最近,分析其他部门在Science杂志发文。为了表征全人类激活组及其DNA理解的性别歧视差异,并找到性别歧视和表型学家如何彼此之间互制约比较简单的等位基因和结核病,分析其他部门在GTEx项目(v8数据发布)调查的44个全人类民间组织举例中的生成了介导及其表型DNA理解的性别歧视差异参考资料,并量化了16245个RNA测序抽取和838个成年个体的DNA型。

在此基本上,分析其他部门报告了介导高度、民间组织细胞子类都由和反式理解定量等位基因启动子(cis-eQTLs)的性别歧视差异。为了评估它们的制约,分析其他部门将这些结果与87个GWAS的DNA特性、激活变异建构评注和全DNA组彼此之间似性分析(GWAS)汇总汇总彼此之间建构。

结果显示,性别歧视对介导的制约是无处不在的 (在所有民间组织中的,分析其他部门鉴定了13 294个有性别歧视差异的DNA)。然而,这些制约很小,而且主要是民间组织选择性的。

不具性别歧视差异理解的DNA主要不是由民间组织选择性介导驱动的,而是参与了一系列多样化的生物特性,如药物和激素反应、胚胎发育和民间组织形态发生、受精、性生殖和精子发生、脂肪代谢、前列腺癌和免疫反应等。

而X彼此之间互连接DNA在女性中的理解高,提示了逃避X染色体失活的候选DNA,;也染色体DNA的性别歧视彼此之间反性理解提示了与激素方面的激活变异DNA理解和额外激活变异的作用,以及表观表型学家标示的性别歧视差异性分布,特别是转移酶H3 Lys27三甲基化(H3K27me3)。

介导的表型DNA理解的性别歧视差异要少得多(在所有民间组织中的鉴定成了369个性别歧视彼此之间反的eQTL),并且不具高度的民间组织选择性。分析其他部门找到了58个由单一性别歧视的介导表型DNA理解驱动的DNA-等位基因彼此之间似性。这些包括性别歧视差异的细胞子类总质量介导DNA型-表现型彼此之间似性的启动子,以及性别歧视似乎在彼此之间似性的潜在化学键前提中的发挥作用非常直接作用的启动子。例如,分析其他部门在肝脏中的找到了一个女性选择性的六激酶HKDC1的eQTL,它制约分娩女性的代谢,随后突显在氏族的成生腰围上。

因此,通过将GTEx数据的性别歧视意识量化与DNA特性和激活变异建构评注彼此之间联合,分析其他部门描述了造成全人类激活组和eQTLs性别歧视差异的民间组织选择性和民间组织资源共享的驱动因素和前提。

分析其他部门找到了多个性别歧视差异的介导不稳定性,这些不稳定性与比较简单的等位基因表型彼此之间似性共轭,从而有助于了GWAS信号的机理解释。

由于许多表现型的致病民间组织是未确定的,因此对多样化的GTEx民间组织收集的量化可以作为调查性别歧视偏倚等位基因基本的庞大资源。这项实习对全人类激活组的性别歧视差异及其表型DNA理解开展了广泛的表征。

原始成处:

Meritxell Oliva et al. The impact of sex on gene expression across human tissues. Science (2020). DOI: 10.1126/science.aba3066

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